De meeste raamkozijnen zijn afkomstig uit het TNO-MEC laboratorium in Delft. De afwijkende vorm van de HER ten opzichte van het donorgebouw leidde tot een herpositionering van de kozijnen. Deze herindeling vereiste creatieve oplossingen: hergebruikte kozijnen op de eerste verdieping werden doorvalveilig gemaakt met beugels en glasstickers. Bovendien was bij sommige kozijnen glasvervanging nodig.

Naast de hergebruikte kozijnen zijn ook nieuwe kozijnen besteld. Dit was noodzakelijk omdat niet alle geoogste kozijnen in het nieuwe ontwerp pasten en omdat er tijdens het oogst- en opslagproces enkele kozijnen verloren zijn gegaan.